Khu công nghiệp Long Giang đã đầu tư xây dựng nhà máy xử ly nước thải tập trung từ năm 2008, nhà máy xử lý áp dụng công nghệ xử lý vi sinh kết hợp với hóa lý có công suất 5000m3/ngày . Nhà máy xử lý đã được Bộ Tài Nguyên Môi Trường cấp giấy phép xả nước thải vào nguồng số: 2651/GP-BTNMT ngày 24 tháng 11 năm 2014.
Hiện nay, nhà máy xử lý nước thải đang tiếp nhận nước thải của các doanh nghiệp trong KCN để xử lý. Nước thải sau khi xử lý đạt loại A theo quy chuẩn Việt Nam QCVN40/2012/BTNMT với Kq =1 và Kf = 0.9.